Missing coverage evidence...
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GTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGC  >  minE/2609967‑2610028                                                              | gTTTGCCATCGGCTTAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2380787/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:3290370/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2507133/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2537077/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2800150/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2836702/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2882501/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:3072151/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:3141818/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:3236252/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2488472/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:465814/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:584379/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:652917/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:697669/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:701726/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:774909/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:865198/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:901113/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2008234/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1043182/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1058786/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1229989/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1334413/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1409579/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1416730/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1445320/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1880264/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1020656/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2105447/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2143386/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2192236/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2204260/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2289175/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2295395/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2388592/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGAGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:2745055/62‑1 (MQ=255)                    ttCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGc  <  1:1890805/43‑1 (MQ=255)                                                              | GTTTGCCATCGGCTAAAATTTCCCCCGCCGTCTGGCGAACGCCAGCGGGCAAAATGCCCAGC  >  minE/2609967‑2610028

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑