Missing coverage evidence...
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CGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAC  >  minE/2619739‑2619785                                               | cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:413254/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:253974/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2709507/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2737079/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2746317/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2840918/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2898704/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:3061000/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:310634/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:3128710/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:3130987/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:3226741/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2483271/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:413568/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:438768/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:505065/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:552057/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:612401/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:731726/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:766106/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:829339/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:868408/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:988224/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:99754/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2436000/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1175919/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1324204/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:133300/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:136271/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1390486/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1412028/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1489434/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1498975/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1526496/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1621968/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1624557/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1686202/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1701111/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1970015/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2071641/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2154234/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2215919/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2221159/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2326319/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:2360640/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:241432/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:10163/47‑1 (MQ=255) cGATCAGTTACAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:435893/47‑1 (MQ=255)  gATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAc  <  1:1104759/46‑1 (MQ=255)                                               | CGATCAGTTTCAGAATCCGGTCAATGGCGCTGGCTCCCGGTTCTGAC  >  minE/2619739‑2619785

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑