Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2631576	2631586	11	40 [0]	[0] 22	livH	leucine/isoleucine/valine transporter subunit

CCGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTC  >  minE/2631516‑2631575                                                            | ccGCGGCGGTGCTCGGTGGTATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1436364/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCTGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:21658/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGTGGCCTGATTc  <  1:2942971/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTTATTc  <  1:1149841/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2405966/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:9304/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2438014/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2457443/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2511856/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2567035/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:258683/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2613241/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:3068541/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:3118096/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:3207934/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:339448/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:406204/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:504878/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:520068/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:630870/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1018111/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2291795/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2182542/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2152380/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2085297/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2057394/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2036448/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2026538/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1271165/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1301438/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1776169/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1346494/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1718442/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1709099/60‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1676286/60‑1 (MQ=255)  cgcgGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGGGGCCTGATTc  <  1:2249536/59‑1 (MQ=255)  cgcgGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:2864806/59‑1 (MQ=255)               ggTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1821877/46‑1 (MQ=255)                 tGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1286352/44‑1 (MQ=255)                  gggATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTc  <  1:1730491/43‑1 (MQ=255)                                                            | CCGCGGCGGTGCTCGGTGGGATTGGCAGCATTCCGGGAGCGATGATTGGCGGCCTGATTC  >  minE/2631516‑2631575

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑