Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2651248	2651294	47	55 [0]	[0] 17	glgX	glycogen debranching enzyme

AACAATTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAACG  >  minE/2651186‑2651247                                                              | aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:368646/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1075427/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:26620/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2813038/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2878681/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2923096/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2959156/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:3006704/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:3020231/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:3020413/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:304415/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:3141146/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:318420/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:33270/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2573961/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:40259/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:439047/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:46359/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:471617/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:474396/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:629294/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:652247/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:685724/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:820961/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:91264/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:968905/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:979209/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1773766/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:114074/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1308757/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1316877/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1352714/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1354915/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1422323/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1473297/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1512033/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1528825/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:153273/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1581236/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1676799/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2570400/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1783336/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1882199/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1937463/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1949607/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:1998327/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2002685/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2160809/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2245136/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2282486/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2328860/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2376368/62‑1 (MQ=255) aacaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:2485026/62‑1 (MQ=255)  acaaTTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:826266/61‑1 (MQ=255)                           agaagGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAAcg  <  1:3015492/36‑1 (MQ=255)                                                              | AACAATTACAGTAACAATCATGGTAAAGAAGGGTTAGGCGGTTCTCTTGACCTGGTTGAACG  >  minE/2651186‑2651247

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑