Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2665589	2665647	59	81 [0]	[0] 74	malT	DNA‑binding transcriptional activator, maltotriose‑ATP‑binding

CAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTA  >  minE/2665527‑2665588                                                              | cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGTGCGAATTTa  <  1:1643434/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2993141/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:407912/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3170021/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3159427/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3149175/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3116976/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3081729/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3054821/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3035405/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:420223/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2963644/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2919518/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2838323/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2802273/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2768861/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2763763/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2700448/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1129034/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2639528/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:701409/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:971918/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:968057/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:96184/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:956972/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:833043/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:822771/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:802117/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:794235/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:768649/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:269358/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:69501/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:670545/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:64460/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:640093/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:543374/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:522217/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:449368/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:42602/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1502289/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1657920/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2624991/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1631509/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1628815/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1599999/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1576325/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1544610/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1528026/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1640047/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1467740/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:142732/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1387516/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1324240/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1303344/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1239306/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1229767/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1136811/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1849943/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:247297/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2388919/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:2388869/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:236041/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1936649/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1896110/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1861036/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1769147/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1736825/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1727026/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:171366/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1680695/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1677983/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1660430/62‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1659626/62‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1529202/61‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:923841/61‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:3225480/61‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1150402/61‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:970180/61‑1 (MQ=255)   ggTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:1272685/60‑1 (MQ=255)      aCTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:382475/57‑1 (MQ=255)                  tttAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTa  <  1:376405/45‑1 (MQ=255)                                                              | CAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTA  >  minE/2665527‑2665588

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑