Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2742150 2742179 30 119 [0] [0] 65 rpsC 30S ribosomal subunit protein S3

Only 100 of 119 total aligned reads displayed.

CACATCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCA  >  minE/2742095‑2742149
                                                      |
tacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1080562/54‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTTGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1836268/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCTGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1508000/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGTCTAGCAATGGGTCa  <  1:1821070/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATTGGTCa  <  1:2952722/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATTGGTCa  <  1:2664919/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3067169/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2444271/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2571127/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:338773/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3164666/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2608033/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3117548/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3110754/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3104161/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3092533/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3089800/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2662910/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3063874/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:3059839/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:383695/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2901152/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2887458/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2747685/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2746908/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2717293/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2682834/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:570583/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:989588/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:97747/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:977273/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:971325/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:914924/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:852096/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:832138/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:821292/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:786384/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:67608/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:623587/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:608500/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:383554/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:567133/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:55439/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:545915/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:533824/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:522561/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:515367/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:512766/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:476106/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:464044/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:420035/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1051054/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:14115/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1770465/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:173870/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2415032/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1633202/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1509518/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1504290/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:148156/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1480568/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1474005/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1451844/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1732949/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1401698/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1351301/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1291959/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1215282/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1165152/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1164290/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1156765/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1082874/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1014507/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1861177/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2380352/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2325371/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2264034/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2261290/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2257170/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2228178/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2183096/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2174524/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2173228/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2155764/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2103137/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2036769/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1847547/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1916336/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1982876/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGGCa  <  1:1992984/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCCCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1166697/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCACTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1087016/55‑1 (MQ=255)
cacaTCACTGTGGTTGAGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2043644/55‑1 (MQ=255)
 acaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1446044/54‑1 (MQ=255)
 acaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1189029/54‑1 (MQ=255)
 acaTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1309231/54‑1 (MQ=255)
   aTCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2395478/52‑1 (MQ=255)
       cTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:2265249/48‑1 (MQ=255)
             ttGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:719906/42‑1 (MQ=255)
                 gtCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCa  <  1:1997613/38‑1 (MQ=255)
                                                      |
CACATCACTGTGGTTGTGTCCGATCGCTGAGACTCTGGAGACTAGCAATGGGTCA  >  minE/2742095‑2742149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑