Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2758601 2758648 48 74 [0] [0] 8 smf conserved hypothetical protein

TCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAT  >  minE/2758539‑2758600
                                                             |
tCACTGTGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2814909/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGTCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:571403/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2490055/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2830180/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2806941/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2790158/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:277824/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2768798/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2707481/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2670840/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2596125/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:285498/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2488231/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2479217/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2478332/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2448222/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2375275/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1007058/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2130247/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:3226065/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:962418/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:936980/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:776022/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:617839/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:535840/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:49845/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:398997/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:332484/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2339653/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:321227/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:3200669/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:3189732/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:3083647/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:3061655/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:3038111/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:288028/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1978478/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1180115/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1223952/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1232757/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1241090/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1360639/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1400867/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1418544/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1428746/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1435306/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1472900/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1473997/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1496856/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1500949/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1553511/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1595259/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1629042/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1643326/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1644327/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2096026/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1667562/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1692424/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1962760/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1696525/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1707840/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1738983/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1833712/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1954215/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1893028/62‑1 (MQ=255)
tCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1923961/62‑1 (MQ=255)
 gaCTGGGTGGGAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCTGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1598841/60‑1 (MQ=255)
 cACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1304215/61‑1 (MQ=255)
 cACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1887683/61‑1 (MQ=255)
 cACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2443330/61‑1 (MQ=255)
 cACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:707490/61‑1 (MQ=255)
 cACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1484045/61‑1 (MQ=255)
 cACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:1076751/61‑1 (MQ=255)
                        tatTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAt  <  1:2911548/38‑1 (MQ=255)
                                                             |
TCACTGGGTGGCAAAACAGTCGCATATTGATGCGGTTGTATTGCAGCAAACAGGGCTTACAT  >  minE/2758539‑2758600

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: