Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2776462	2776465	4	74 [0]	[0] 5	arpA	regulator of acetyl CoA synthetase

TTTTTATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATCC  >  minE/2776400‑2776461                                                              | tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2549784/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3029425/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2994979/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2952006/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2749519/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2741518/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2708668/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2621755/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2560334/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3069926/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2511436/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2489907/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2423684/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2374377/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1042111/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2341600/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2313690/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:626230/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:999270/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:930537/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:92827/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:917735/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:767641/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:757454/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:728573/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:714191/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2363902/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:510804/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:34115/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3276029/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3205212/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:319648/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3163122/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3097412/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:129292/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1629864/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:226993/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:145952/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1451532/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1402605/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1393208/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1325725/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1302182/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1568133/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1267063/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1263824/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1213342/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1208752/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1191640/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1181536/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1179758/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1057168/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1802137/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2248812/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:219103/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2152361/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2027468/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2003131/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1950310/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1876263/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1829988/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1647466/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1798420/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1763705/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1723325/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1708063/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1683495/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:1677592/62‑1 (MQ=255) tttttATCTTTTGCCTCCAGAATACGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3077131/62‑1 (MQ=255) tttttATCATTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:3254256/62‑1 (MQ=255)  ttttATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:333980/61‑1 (MQ=255)                   aGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:408202/44‑1 (MQ=255)                   aGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:829167/44‑1 (MQ=255)                         tGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATcc  <  1:2485374/38‑1 (MQ=255)                                                              | TTTTTATCTTTTGCCTCCAGAATATGCATGAGATTTTTTTTCGAGAGTAATCCTTCATATCC  >  minE/2776400‑2776461

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑