Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2776590	2776590	1	59 [0]	[0] 47	arpA	regulator of acetyl CoA synthetase

TAAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCA  >  minE/2776528‑2776589                                                              | taAACCTGGGAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:3144221/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCTGGTTAATTCTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1186648/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTTTTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2893719/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2638626/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2519584/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2714251/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:273483/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2744643/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2816829/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2827789/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2846879/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2864499/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2917285/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2928273/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2944082/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:3033126/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:3069569/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:314656/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:3198475/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:3285584/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:40734/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:464832/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:498231/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:622277/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:641282/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:650897/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:671861/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:689556/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:699576/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:833024/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2000598/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1150048/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1212945/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1315159/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:134934/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1405420/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1467493/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1494627/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1538275/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1554210/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1583156/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1594730/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1643088/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1759446/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1803967/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2535674/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2220182/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2237817/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2300468/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:230223/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2311282/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2349452/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2369291/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2424381/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2431863/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2437814/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2454332/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:2498291/1‑62 (MQ=255) taAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCa  >  1:1141702/1‑62 (MQ=255)                                                              | TAAACCTGGCAGGTTAATACTATTATAGGCAGTCAACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCA  >  minE/2776528‑2776589

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑