Missing coverage evidence...
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TTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGC  >  minE/2786702‑2786764                                                            |    ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2575419/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:959513/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:932853/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:772295/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:512115/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:45287/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:428632/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:3272325/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:3263130/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:3013367/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2951402/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2659323/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2607373/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2585921/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2582964/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1059381/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2435807/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2270634/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2251874/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2067184/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:2040046/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1949960/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:189963/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:185554/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1506169/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1482303/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1454490/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1431618/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1322947/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATcc     >  1:1105091/1‑60 (MQ=255) ttAATGCTGTTGGTTTCGGAGTT‑GTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCcagc  >  1:643613/1‑62 (MQ=255)                                                            |    TTAATGCTGTTGGTTTCGGAGTTGGTCAATACGCGACCATGCGCAATCCGCGCCCGATCCAGC  >  minE/2786702‑2786764

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑