Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2796044	2796083	40	55 [0]	[0] 60	lexA	DNA‑binding transcriptional repressor

AAAGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATCACA  >  minE/2795992‑2796043                                                    | ataGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1100028/50‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGATGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1736465/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2726699/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:922310/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2729248/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:277965/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2816715/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2891837/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2895564/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2946814/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3058876/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:308473/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3108824/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3135245/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3157852/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:317278/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3215113/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3250537/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:3292158/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:338121/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:352105/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:352171/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:400669/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:525817/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:653512/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:770331/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:822961/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1064332/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2259264/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1315774/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1353585/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1370621/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1431486/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:143477/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1449084/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1710125/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1770297/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1781596/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:1954020/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2034129/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2149668/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2255376/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2701471/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2299618/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2318363/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:233118/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2376709/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2383121/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2473766/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2497741/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:25323/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2539174/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2584412/52‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2684003/52‑1 (MQ=255)               cAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATcaca  <  1:2911094/38‑1 (MQ=255)                                                    | AAAGCGTTAACGGCCAGGCAACAAGAGGTGTTTGATCTCATCCGTGATCACA  >  minE/2795992‑2796043

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑