Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2824339 2824359 21 138 [1] [0] 11 pheU/yjdC tRNA‑Phe/predicted transcriptional regulator

Only 100 of 138 total aligned reads displayed.

CGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAGTAAAAGCGATTCA  >  minE/2824291‑2824351
                                               |             
cGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAGTAAAAGCGATTCa  <  1:543788/61‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCTCATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2308615/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:363702/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:365407/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:355113/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3275317/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3270237/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3254746/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3242340/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3204634/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3177887/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3176169/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3174081/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3123561/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:3010272/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2993136/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2980104/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2972917/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2959648/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2897852/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2889500/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2842776/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2826892/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2805199/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2789022/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2772765/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:650359/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:951937/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:937576/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:851301/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:832176/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:809885/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:778583/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:767391/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:717119/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:714995/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:712207/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:664883/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2772676/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:603764/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:550651/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:500547/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:492119/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:491809/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:444841/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:441805/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:423369/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:392945/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:38112/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:367301/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1436937/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1877229/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1843128/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1824036/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:177495/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:176288/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:175417/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1720922/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1700847/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1680449/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1530376/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1503590/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1480227/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:193324/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1426587/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1346584/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1303025/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1291290/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1274904/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1270834/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1209047/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1183349/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1142646/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1085974/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1074329/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2297215/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:27574/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2715309/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2604256/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2575557/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2544899/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:245618/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2444801/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2416710/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:241366/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:236266/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2331893/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2317205/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1025640/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2269573/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2184775/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2118088/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2062554/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2055856/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2028510/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:2020394/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1997429/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1992634/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAg               <  1:1968594/37‑1 (MQ=255)
           aaaCCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCCAATTTCAg               <  1:3197931/37‑1 (MQ=255)
                                               |             
CGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAGTAAAAGCGATTCA  >  minE/2824291‑2824351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: