Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2857840	2857842	3	37 [0]	[0] 10	amiB	N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II

CGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCG  >  minE/2857779‑2857839                                                             | cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCATGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1419167/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:3251702/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2679028/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2699306/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2706034/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2983299/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:30460/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:3116292/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:3145327/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:3162218/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:321689/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2517708/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:336034/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:540022/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:735648/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:743559/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:830317/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:870448/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:888031/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1733498/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1166502/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1401685/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1417714/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1486454/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1486778/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1536601/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1700893/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:262884/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1795927/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1847670/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1872531/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1999631/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2007491/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2055435/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:2246563/61‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:105184/61‑1 (MQ=255)          gtgCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGcgcg  <  1:1545456/52‑1 (MQ=255)                                                             | CGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCG  >  minE/2857779‑2857839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑