Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2897241	2897256	16	53 [0]	[0] 30	mpl	UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanyl‑gamma‑D‑glutamyl‑ meso‑diaminopimelate ligase

ATATTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGC  >  minE/2897179‑2897240                                                              | atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:347629/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1009015/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2086004/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:234019/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2406553/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2417823/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2489231/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2588648/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2594563/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2831591/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2845717/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2969276/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:3012782/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2075805/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:348942/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:359073/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:393455/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:409020/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:58472/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:598859/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:80491/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:859727/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:871831/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:883433/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:913584/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:921351/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1529898/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1015648/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1095837/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1109518/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1182943/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1234621/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1263551/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1293159/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1296204/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1301702/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1318477/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1456512/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:146113/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:150729/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1955372/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1540088/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1578066/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1593993/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1639477/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1653238/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:174074/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1806921/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1830617/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1908356/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:1923443/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTAGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:273941/1‑62 (MQ=255) atatTTTAGGAA‑TTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGc  >  1:2852616/1‑61 (MQ=255)                                                              | ATATTTTAGGAATTTGTGGCACATTTATGGGCGGTCTGGCGATGCTGGCGCGCCAGTTAGGC  >  minE/2897179‑2897240

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑