Missing coverage evidence...
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ATGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAG  >  minE/261807‑261868                                                              | aTGGAGCAATTTAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2446059/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:50193/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1056171/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2635873/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2733692/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2761519/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:3074320/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:3196922/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:3257556/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:410842/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:443658/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:261350/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:661492/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:678378/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:830210/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:832156/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:89701/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:942484/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:951177/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:966046/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:974035/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2551653/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1090917/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1106816/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1246419/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1283805/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:135044/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1383974/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1393566/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1506756/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1650231/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:186859/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2021711/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2084310/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2094938/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2370934/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2396580/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2449945/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2472506/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:2593868/62‑1 (MQ=255) aTGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCCCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:763777/62‑1 (MQ=255)  tGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:1767764/61‑1 (MQ=255)       cAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAg  <  1:674154/56‑1 (MQ=255)         aTTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTTTCTACCGCAg  <  1:377965/54‑1 (MQ=255)                                                              | ATGGAGCAATTGAAAAAGCTCGATAAAGTCGCCTATATCCGTTTTGCCTCTGTCTACCGCAG  >  minE/261807‑261868

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑