Missing coverage evidence...
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ATGGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGAA  >  minE/2922895‑2922956                                                              | atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1248179/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:941766/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:79358/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:595801/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:415232/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:395058/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:342231/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:3254624/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:3192713/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:3144884/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:3021016/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:3017327/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2971629/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2851834/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:250912/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2455783/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1945542/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1091647/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1365260/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1366282/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1645509/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1887397/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1905303/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1942428/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2377443/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1958205/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:19716/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2010211/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2019912/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2162620/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAATACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2629539/62‑1 (MQ=255) atgGTGTCGGCAGTAATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:3026567/62‑1 (MQ=255) atgGTGGCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:1285990/62‑1 (MQ=255)  tgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2775890/61‑1 (MQ=255)  tgGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGaa  <  1:826633/61‑1 (MQ=255)                       aaaGTACTTTCACACGCTGCCATAGGGTTTCGGTGATGaa  <  1:2935307/40‑1 (MQ=38)                                                              | ATGGTGTCGGCAGTGATACCGCAAAGTACTTTCACACGCTGCCAGATGGTTTCGGTGATGAA  >  minE/2922895‑2922956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑