Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2954066	2954121	56	89 [0]	[0] 30	[holD]	[holD]

CATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTG  >  minE/2954028‑2954065                                      | cATATGTTGGCGCGGTATCGACGGATTTGCTATATTTg  <  1:1086386/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGGATTTGCTATATTTg  <  1:1090225/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATCTTTg  <  1:2216416/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2758047/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:3232436/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:3158886/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:3078615/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2996005/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2994493/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2879077/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2865924/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2845865/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2836328/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2818772/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:3258585/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2741596/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2706757/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:270376/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2689276/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2649134/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:261237/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2603206/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2591773/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2583777/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:634208/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:99221/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:97155/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:947666/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:930340/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:923670/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:912007/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:857580/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:762840/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:73231/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:686001/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:3252872/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:610553/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:58072/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:565450/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:563592/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:514807/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:455187/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:436561/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:413811/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:10536/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1535153/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1864602/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:180352/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1758270/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:172202/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1690982/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1681437/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1668927/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1657591/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1575006/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1544059/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2529631/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1531838/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1463331/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1404084/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1394131/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1330499/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1246790/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1162859/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1070319/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1049009/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1869529/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2504646/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2488473/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2480834/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2412983/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2404582/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2329971/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:231600/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2282041/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2174626/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2102141/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2101917/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2098186/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2020508/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1980231/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1978376/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1945502/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1913566/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATAATTg  <  1:2603593/38‑1 (MQ=255) cATATGTTGGCGCGGTATCAACGAATTTGCTATATTTg  <  1:610882/38‑1 (MQ=255)  atatGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:50594/37‑1 (MQ=255)   tatGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:1851110/36‑1 (MQ=255)    atGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTg  <  1:2554232/35‑1 (MQ=255)                                      | CATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTG  >  minE/2954028‑2954065

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑