Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	277335	277481	147	54 [0]	[0] 7	cyoB	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

ATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAT  >  minE/277294‑277334                                         | aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGTCGAt  >  1:2315168/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:3035708/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2450632/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2468960/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2571889/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:26108/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2726625/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:278312/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2817175/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2834378/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2854370/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2901987/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:29602/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:3027011/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2435997/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:3106214/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:3164490/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:3238047/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:38036/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:410999/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:463415/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:478054/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:827194/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:827434/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:860939/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:894679/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:925801/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1707161/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1022882/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1033704/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:104787/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1078086/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1163839/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1176133/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:137317/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1474854/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1494985/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:165836/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1659242/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1682852/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1685031/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1020561/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:179682/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1936590/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1957968/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:1997956/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2095560/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2111747/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2115434/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2266897/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2331277/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2334399/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:234428/1‑41 (MQ=255) aTGGCGAAACCGAAGATGGAGGAGAAAGCTGCAATGACGAt  >  1:2904726/1‑41 (MQ=255)                                         | ATGGCGAAACCGAAGATGGTGGAGAAAGCTGCAATGACGAT  >  minE/277294‑277334

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑