Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	301105	301158	54	79 [0]	[0] 72	glnK	nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB

CGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCT  >  minE/301044‑301104                                                             | cGAATTCTGACTGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2860333/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTTACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:396325/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:433948/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:438852/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:419188/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:393920/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:382913/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3284889/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3258875/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3239301/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3207231/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3186428/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3140391/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3118739/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3113840/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3096531/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:3013714/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2975401/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2963362/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2912221/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:732800/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:993529/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:957415/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:957097/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:954372/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:922383/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:899785/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:816310/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:805819/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:798041/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:283804/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:716079/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:70746/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:698199/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:660327/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:654492/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:573400/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:550363/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:545504/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1715319/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1006883/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2013804/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2012900/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2000347/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1965480/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1965125/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:19500/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1926921/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1793863/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:202155/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:170282/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1689695/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:168004/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1652671/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1583359/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1421825/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1191152/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1130044/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:1067435/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2350014/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2809620/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2779294/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2735629/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2678037/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2645629/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2634741/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2428643/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2367213/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2025123/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2292016/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2179768/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2170786/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2125889/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2079118/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2064805/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2045308/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:2029561/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAAGCAAACCATTCAAGCt  >  1:2051457/1‑61 (MQ=255) cGAATTCTGACAGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCt  >  1:891583/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGAATTCTGACCGGAGGGGATCTATGAAGCTGGTGACCGTGATAATCAAACCATTCAAGCT  >  minE/301044‑301104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑