Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	312545	312610	66	11 [0]	[0] 3	acrB	multidrug efflux system protein

CGCTCACCCCT‑‑‑TGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGTT  >  minE/312488‑312544                                                            | cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:1554047/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:2109046/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:2195267/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:2403666/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:2541862/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:2633950/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:2674941/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:308735/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:3109683/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:517663/60‑1 (MQ=255) cGCTCACCCCTTGCTGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGtt  <  1:944837/60‑1 (MQ=255)                                                            | CGCTCACCCCT‑‑‑TGCTGCTGAACTTCTTGCGGCAGCAACGGCATCGCCAGCTGCAGTT  >  minE/312488‑312544

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑