Missing coverage evidence...
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TGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATCCC  >  minE/331545‑331606                                                              | tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:3177436/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1084715/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2596535/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2604703/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2695114/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2928634/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2930169/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2999822/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:3074780/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:3089218/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:3139061/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2582054/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:3228905/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:3237571/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:409545/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:432039/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:55897/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:602092/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:651009/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:723898/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:964019/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:982067/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2044248/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1229692/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1237048/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1238407/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1356568/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1468608/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1481582/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:154612/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:165377/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1797032/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:1896436/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:255621/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2050312/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2093263/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2094459/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2251360/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:228987/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2393990/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2449256/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2481288/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2541222/62‑1 (MQ=255) tGGTATCGGCAACAAAGCCAGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:470439/62‑1 (MQ=255)                      gAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATccc  <  1:2214446/41‑1 (MQ=255)                           aaTGGTCCTGCCAGCTCTCCCGCTAACAGATATccc  <  1:3125731/36‑1 (MQ=38)                                                              | TGGTATCGGCAACAAAGCCCGGAGTGAATGGTCCTGCCAGCACACCCGCTAACAGATATCCC  >  minE/331545‑331606

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑