Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 358746 358747 2 19 [0] [0] 26 sfmC/sfmD pilin chaperone, periplasmic/predicted outer membrane export usher protein

TCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGA  >  minE/358684‑358745
                                                             |
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:3071454/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:955046/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:74671/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:687992/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:678676/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:417842/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:336937/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:3262930/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:3159854/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:1132094/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:2965254/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:2920772/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:2657277/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:2495715/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:1929901/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:1769251/62‑1 (MQ=255)
tCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:1389186/62‑1 (MQ=255)
 cAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:779694/61‑1 (MQ=255)
  aGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGa  <  1:1750756/60‑1 (MQ=255)
                                                             |
TCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGA  >  minE/358684‑358745

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: