Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	359229	359232	4	51 [0]	[0] 111	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

TTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACA  >  minE/359167‑359228                                                              | tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:607138/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1021863/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2252423/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2255463/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2411173/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:288132/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:3033864/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:3048888/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:3100954/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:3220835/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:379891/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:503699/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:521894/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2245870/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:647288/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:659145/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:686663/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:702527/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:776912/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:859988/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:89013/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:901261/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:932799/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:933545/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:938251/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1544583/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1037516/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:104808/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1186717/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1196564/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1200329/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1317406/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1367017/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:148495/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1539381/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2187281/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1647312/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1758766/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1762603/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1859419/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1886796/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2017101/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2115429/62‑1 (MQ=255) tttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGACTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2985552/62‑1 (MQ=255) tttACAGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:193067/62‑1 (MQ=255)  ttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:174363/61‑1 (MQ=255)  ttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1861728/61‑1 (MQ=255)  ttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:1257269/61‑1 (MQ=255)  ttACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:2004525/61‑1 (MQ=255)       gAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:10578/56‑1 (MQ=255)                      tGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACa  <  1:799407/41‑1 (MQ=255)                                                              | TTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACA  >  minE/359167‑359228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑