Missing coverage evidence...
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TCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGG  >  minE/369884‑369942                                                           | tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:352432/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2108202/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1084363/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2248588/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2689433/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2699553/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2902235/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2994717/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:3005582/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:3256682/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:3272865/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:3291713/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:22216/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:386281/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:415948/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:461473/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:718514/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:72292/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:816029/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:856527/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:918081/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:919531/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:923023/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:955939/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1813733/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1284958/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1339702/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1349394/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1385844/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1405812/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1458079/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:150590/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1603890/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1700345/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1708221/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1709558/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1742306/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2104599/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1853943/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1876725/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1884520/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1946975/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1963210/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:1972655/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2012910/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2043805/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2099686/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGATCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:230769/59‑1 (MQ=255) tCGACTGGGCTCGGCAGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:2257652/59‑1 (MQ=255)                        cGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTgg  <  1:3082011/36‑1 (MQ=255)                                                           | TCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGG  >  minE/369884‑369942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑