Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	408376	408408	33	72 [0]	[0] 13	holA	DNA polymerase III, delta subunit

CATGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTG  >  minE/408323‑408375                                                     | catTCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:972038/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGTTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1457091/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:3006241/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2397903/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2993926/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2863723/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2842264/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2779570/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2731679/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2680189/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2676429/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2606544/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2561301/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2548110/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:252141/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2482137/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2435179/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2405609/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2396029/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:676808/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:948715/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:935008/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:933388/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:828119/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:817497/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:800632/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:730409/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:716232/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:3093198/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:666469/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:559374/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:522121/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:3268074/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:3171449/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:3096552/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:3093610/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1420552/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:171457/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1650495/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1622103/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1540802/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1527002/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1475333/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1473832/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1447208/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2393001/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1418042/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1306524/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1279197/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1224512/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1097092/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1072594/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1070647/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1847801/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2376002/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2282809/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2281395/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2244204/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2227509/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2221873/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2202249/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2121672/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2119890/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2114507/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:203852/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:2023171/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1966764/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1720085/53‑1 (MQ=255) catGCCCCGGCGGTTCTACCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:1025155/53‑1 (MQ=255)       ccGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:197699/47‑1 (MQ=255)          gcggTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:533924/44‑1 (MQ=255)                   ccATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTg  <  1:105132/35‑1 (MQ=255)                                                     | CATGCCCCGGCGGTTCTGCCATACCCGATGCTTATCAAACAACGCACGCAGTG  >  minE/408323‑408375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑