Missing coverage evidence...
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TTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAC  >  minE/409484‑409545                                                              | ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:2896152/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:990919/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:961830/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:64599/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:499262/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:461633/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:447981/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:434958/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:398231/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:325663/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:3043609/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:2960665/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:2939308/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:292697/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1898750/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1023539/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1218734/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1490810/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1507840/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1521348/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1522453/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1547172/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:254656/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:190244/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:2239352/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:2261974/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:2300112/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:235016/62‑1 (MQ=255) ttACGGAATACCGATGCGGTACCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:303196/62‑1 (MQ=255) ttACGAAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:544893/62‑1 (MQ=255)  tACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTTCCCAAACGCAAGGATGGAAc  <  1:1004898/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTACCCAAACGCAAGGATGGAAC  >  minE/409484‑409545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑