Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	411191	411232	42	96 [0]	[0] 34	leuS	leucyl‑tRNA synthetase

CGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAC  >  minE/411155‑411190                                    | cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2982532/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3263375/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3216051/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3181879/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3165266/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3144403/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3083577/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3066776/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3054636/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3048743/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:304419/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:3035963/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:347738/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2912562/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2840394/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2815194/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2740255/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2701248/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2630663/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2620520/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2488557/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2483927/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2421058/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2417242/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:706180/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:927083/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:892284/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:873464/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:862973/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:850917/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:820978/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:812839/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:807838/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:804877/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:764383/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:759731/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2377282/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:691000/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:620211/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:620204/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:592476/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:571219/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:509910/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:505967/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:496834/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:481463/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:466022/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:437499/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1331564/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1639291/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1566889/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1555610/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1554338/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1550091/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1539376/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1531481/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1476573/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1467310/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1427562/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:140935/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1647833/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1330302/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1287442/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1278627/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1261421/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1250593/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1196317/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1179855/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1097867/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1072549/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1056306/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1028887/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1960758/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:23613/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2278974/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2259665/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2239743/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2205391/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2176654/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2162793/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2130890/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2037688/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:2013268/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1973723/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1007498/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1923982/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1905383/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1885429/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1868480/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1842734/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1823445/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1801373/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1721437/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1680660/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1673309/1‑36 (MQ=255) cGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAc  >  1:1652171/1‑36 (MQ=255)                                    | CGGCGATGGCGTTGAAGGCCGCTTCATGGTCAAGAC  >  minE/411155‑411190

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑