Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	445172	445210	39	28 [1]	[0] 8	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

GTCGGTTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAGT  >  minE/445111‑445172                                                             |  gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACTTCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2002587/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2695431/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:947773/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:889066/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:856237/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:605099/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:582007/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:422949/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:3223097/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:319460/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:3150500/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:3143475/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:3000670/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2975380/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:1339210/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2315135/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2278282/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2251638/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2202718/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2164244/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2163859/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2139200/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:2014834/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:1918062/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:186227/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:1599699/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAg   >  1:1398620/1‑61 (MQ=255) gtcggtTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCG‑CCGACAAATTGCCAGt  >  1:502140/1‑61 (MQ=255)                                                             |  GTCGGTTGAACGCGGTAATAGTGCCCCCGTGTACATCCACTATCGCCCGACAAATTGCCAGT  >  minE/445111‑445172

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑