Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 446033 446038 6 88 [0] [0] 18 kdpD fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

AACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGT  >  minE/445981‑446032
                                                   |
aaCTCCACTTCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2496853/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3027479/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3229899/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3218036/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3204100/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3139318/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3137136/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3115819/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3106857/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3072484/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3062185/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:304682/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:356330/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:3016091/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:299315/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:289540/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2892026/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2851920/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2787563/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2766399/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2683601/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2659084/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:67873/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:891689/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:843593/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:795556/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:780791/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:746618/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:730644/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:723936/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:707306/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:69639/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:688813/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2527891/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:648617/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:610499/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:577254/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:571824/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:512136/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:501523/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:473446/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:422213/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:4060/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:389501/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1427002/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1823264/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1006335/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1693537/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1662492/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1595983/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:157604/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1553142/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1549796/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1539042/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1430761/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1742245/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1419742/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1389293/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1382406/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1371949/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1320661/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1293994/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1200358/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1193366/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1111648/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2071336/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2522155/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2475120/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:244763/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2253142/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2231542/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2221640/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2149762/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2139520/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1835259/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2042676/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2015457/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:193995/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1919928/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1911378/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1906069/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1892549/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:183876/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGAGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1555028/52‑1 (MQ=255)
aaCTCCACTGCGCGATGGCATCGGCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1191393/52‑1 (MQ=255)
 aCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCGTTGCGGATgtgt  <  1:729075/51‑1 (MQ=255)
 aCTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:1947599/51‑1 (MQ=255)
     cACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATgtgt  <  1:2373208/47‑1 (MQ=255)
                                                   |
AACTCCACTGCGCGATGGCATCGTCCCACGGCGTCATTCCTTGCGGATGTGT  >  minE/445981‑446032

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: