Missing coverage evidence...
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TTATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTGG  >  minE/452773‑452834                                                              | ttATCGCCTCGCCTGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:579957/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3292211/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:2766418/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3002870/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3022027/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:304785/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3077770/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3104240/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3112377/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3124173/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3194482/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:3221130/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:2538521/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:413765/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:464603/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:466220/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:489148/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:608083/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:692623/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:757966/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:807546/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:818292/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:841653/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:933672/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1023282/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1128045/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1163525/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1164400/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1292094/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1527710/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1634568/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1646969/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1696789/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1902954/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:195529/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1977322/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:2123499/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:2156426/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:2239848/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:234784/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:2376579/62‑1 (MQ=255) ttATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:238533/62‑1 (MQ=255)  tATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:937532/61‑1 (MQ=255)   aTCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGAgg  <  1:1011852/60‑1 (MQ=255)             cAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1787176/50‑1 (MQ=255)             cAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTgg  <  1:1000172/50‑1 (MQ=255)                                                              | TTATCGCCTCGCCAGTGCTTGCATCGCTTGTTGGCTGAACAGCCGCAGGCGCTGGACGGTGG  >  minE/452773‑452834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑