Missing coverage evidence...
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GGATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAT  >  minE/460460‑460521                                                              | ggATTTTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2397796/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:3117680/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2542695/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2609535/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2679542/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2767429/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2795758/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2912905/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2927643/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:3043236/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:241939/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:477493/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:607150/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:632802/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:656258/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:720272/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:757057/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:767900/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:772736/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1818142/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1114994/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1242101/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:130623/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1497208/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1555197/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1612848/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1760174/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1805265/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1060762/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1878107/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:1968096/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2020395/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2064299/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2248177/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2297819/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2320076/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:2341888/1‑62 (MQ=255) ggATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACCCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAt  >  1:451075/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGATTGTTAACATCCAGCGAGTCGTGATAGAACGCCGCCAGCGCGCCGGTAATACCACACAT  >  minE/460460‑460521

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑