Missing coverage evidence...
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CGTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGA  >  minE/475294‑475352                                                           | cgTATGTATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:1223303/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATTAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:961760/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:390132/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:968019/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:890803/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:86353/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:71752/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:694618/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:649891/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:63165/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:1012802/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:3061215/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:2873795/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:2654907/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:2387621/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:2210491/59‑1 (MQ=255) cgTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGa  <  1:1187811/59‑1 (MQ=255)                                                           | CGTATGGATATCAAAATTGCCCACGCGCGTATTGAAAATAAGATTGTTAATCTGCTGGA  >  minE/475294‑475352

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑