Missing coverage evidence...
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CGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTACTTCTT  >  minE/489716‑489769                                                      | cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2208134/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:569314/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:356796/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2951206/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2889403/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2575599/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2273185/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2264882/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:1123232/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2140005/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2093178/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:1867218/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:1833454/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:1614851/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:1428754/54‑1 (MQ=255) cGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCAAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:2031003/54‑1 (MQ=255)  gggTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:3289555/53‑1 (MQ=255)  gggTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTActtctt  <  1:1237262/53‑1 (MQ=255)                                                      | CGGGTTGCTGTGTATTGGCCTTGCCAGTCTGGAGAAGATCAGCAACTACTTCTT  >  minE/489716‑489769

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑