Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	521021	521031	11	77 [0]	[0] 2	uvrB	excinulease of nucleotide excision repair, DNA damage recognition component

GATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAT  >  minE/520959‑521020                                                              | gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2833021/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3212220/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3102250/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3090827/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2956667/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:293255/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2927934/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2908075/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:290716/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2894672/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3216882/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2747889/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2727625/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2706676/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2696449/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2561410/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2560753/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2531002/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1018384/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:607995/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:891212/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:890155/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:844099/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:821466/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:8160/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:795709/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:782592/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:702023/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2516917/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:518909/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:500141/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:460836/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:377688/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3268756/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3256658/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3220856/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3218580/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1603537/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2515208/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1831664/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1798807/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1791255/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1760185/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1707624/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1675396/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:165255/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1623744/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:189320/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1576657/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1537431/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1498497/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1356394/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1288413/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1233461/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1229865/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1204911/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2239801/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2481731/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2470381/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2441909/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2326847/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2321100/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2317705/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2279804/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2279619/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2276453/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1931061/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2122762/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2120846/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2034078/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2027457/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2014048/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:2008821/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:1962303/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTAACCATTCCACAAAt  >  1:2708141/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTAACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:470383/1‑62 (MQ=255) gATTACCTGCCTACCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAt  >  1:3242129/1‑62 (MQ=255)                                                              | GATTACCTGCCTGCCGATGGGCTGCTGGTCGTCGATGAATCTCACGTCACCATTCCACAAAT  >  minE/520959‑521020

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑