Missing coverage evidence...
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TACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCTTT  >  minE/524148‑524209                                                              | tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:298574/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:994786/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:989920/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:966022/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:908878/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:839393/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:697465/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:444947/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:3154684/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:3101423/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:3032134/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2991872/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:1137554/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2780098/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2614220/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:247909/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2361719/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2248611/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2100293/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:1891824/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:1677520/62‑1 (MQ=255) tACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:1477036/62‑1 (MQ=255) tACTGAGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:1515783/62‑1 (MQ=255)  aCTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:2272473/61‑1 (MQ=255)  aCTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:1442051/61‑1 (MQ=255)  aCTGCGGCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:746469/61‑1 (MQ=255)  aCTCCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCttt  <  1:699097/61‑1 (MQ=255)                                                              | TACTGCGTCGCGGCTGGATCCACCAATTACGTCAACGCAGCGACGGTCCCGCGCAAGTCTTT  >  minE/524148‑524209

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑