Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	540464	540507	44	23 [0]	[0] 2	rhtA	threonine and homoserine efflux system

AGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATC  >  minE/540402‑540463                                                              | aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2418147/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:870168/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:719011/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:671161/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:634181/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:513841/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:3287224/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:3266230/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:3123754/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2850716/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2769494/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2728662/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:1065646/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2352012/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2318464/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2291172/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2154563/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:2128458/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:1948860/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:1856061/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:122489/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:1222939/1‑62 (MQ=255) aGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATc  >  1:1143823/1‑62 (MQ=255)                                                              | AGTGCCAGAGTGCTTCACCAGCCTGAAGCGCTCCAATTGGCACGAAAATTAACGCTGCAATC  >  minE/540402‑540463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑