Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	557474	557512	39	32 [0]	[0] 37	[iaaA]	[iaaA]

ATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAT  >  minE/557412‑557473                                                              | aTTGAATGAGTAATTCTTAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2584131/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:3200597/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2953238/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2685525/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2609594/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2168624/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2056398/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1867210/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:3206061/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:404942/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:435504/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:764905/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1285429/62‑1 (MQ=255) aTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1252521/62‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:930890/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:3194704/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:3176739/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:3074718/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:899983/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:101057/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:3059913/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2583412/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2551987/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2321289/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:2028489/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1730208/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1408923/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1339257/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1184443/61‑1 (MQ=255)  ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1119757/61‑1 (MQ=255)   tGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:79713/60‑1 (MQ=255)                  tAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAt  <  1:1453494/45‑1 (MQ=255)                                                              | ATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAAT  >  minE/557412‑557473

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑