Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 621459 621468 10 68 [0] [0] 22 ycaI conserved inner membrane protein

CAACAATGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCTT  >  minE/621397‑621458
                                                             |
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2867936/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:366973/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:3189780/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:3136331/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:3129304/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:3055882/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:3036953/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2975230/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2957595/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:411687/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:285813/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2832636/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2818189/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2793681/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2538031/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2514471/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1037598/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2504398/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:443282/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:472877/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:489101/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:568032/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:629196/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:648400/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:741116/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:752822/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:796901/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:805399/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:811123/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:83193/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:877124/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:951646/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:956214/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2440591/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1086211/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:10981/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:119417/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1336170/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1345521/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1374269/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1384209/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1554579/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1574285/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:16008/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1687901/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1743601/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1758622/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1880223/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2307822/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2459947/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2427395/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:239003/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2354730/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1888165/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2272574/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2259889/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2162040/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2060534/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1973842/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1947833/62‑1 (MQ=255)
caacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGGGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2681101/62‑1 (MQ=255)
 aacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1394435/61‑1 (MQ=255)
 aacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1363898/61‑1 (MQ=255)
 aacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:113018/61‑1 (MQ=255)
 aacaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1877273/61‑1 (MQ=255)
  acaaTGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:1363845/60‑1 (MQ=255)
                      aaGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2045664/40‑1 (MQ=255)
                           cGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCtt  <  1:2540055/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
CAACAATGGTCAATGAAACTCAAAGTTCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCTT  >  minE/621397‑621458

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: