Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	661946	662066	121	42 [0]	[0] 66	pyrD	dihydro‑orotate oxidase, FMN‑linked

ATCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGA  >  minE/661884‑661945                                                              | aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTTTGGa  <  1:714732/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:408476/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2805587/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:286513/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2943481/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:3086594/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:3089135/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:3116743/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:3125994/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:3293061/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:332122/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2657224/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:560232/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:572273/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:589623/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:655411/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:682066/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:695073/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:770361/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:965473/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1689850/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1113020/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1144883/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:116538/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1195203/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1409608/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1511414/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:151266/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1545955/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:167543/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2631297/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:180840/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:201947/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2106643/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2408722/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2438664/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:253574/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2549709/62‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2579937/62‑1 (MQ=255)     gCAAAAATAAAGTTACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:1090058/58‑1 (MQ=255)     gCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:464189/58‑1 (MQ=255)                     gCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGa  <  1:2243940/42‑1 (MQ=255)                                                              | ATCGGCAAAAATAAAGATACGCCAGTGGAGCAGGGCAAAGATGACTATCTGATTTGTATGGA  >  minE/661884‑661945

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑