Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	34962	35070	109	80 [0]	[0] 16	caiC	predicted crotonobetaine CoA ligase:carnitine CoA ligase

GCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAGG  >  minE/34901‑34961                                                             | gCGAAGCGCATGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2107518/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2574627/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:302713/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:3006363/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2999179/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:286792/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2857282/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2790266/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2772396/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2731450/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2616093/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:3057736/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2521866/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2510474/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2344018/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2333017/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2253707/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2245690/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2190159/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:670269/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:954359/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:920700/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:898400/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:816247/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:794670/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:759537/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:733313/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:706001/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:695197/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2240518/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:621576/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:592823/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:496481/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:384571/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:366204/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:3243919/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:314443/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:3127970/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1244834/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1559328/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1526621/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1460098/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1454119/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1407245/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1377721/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1366475/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1354244/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1330078/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:212557/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1239947/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1234824/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1205552/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1115762/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1114102/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1102100/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1088661/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1079855/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1074475/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:181659/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2154154/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2060383/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2021487/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1978765/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:193656/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1926563/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1899372/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1573157/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1784958/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1752858/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:167553/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1653338/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1649026/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1592631/61‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGGGCCGGAgg  <  1:388420/61‑1 (MQ=255)  cGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1046864/60‑1 (MQ=255)  cGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:3117981/60‑1 (MQ=255)      gcgcAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:2623711/56‑1 (MQ=255)           tgTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:1624641/50‑1 (MQ=255)                           caccacACCTTTCGGTCGGGAGGTGTTGCCGGAgg  <  1:2071412/35‑1 (MQ=255)                           caccacACCTTTCGCTCGGGAGGTGGTGCCGGAgg  <  1:897986/35‑1 (MQ=255)                                                             | GCGAAGCGCAGGTTGTAATGGGTAATCACCACACCTTTCGGTCGGGAGGTGGTGCCGGAGG  >  minE/34901‑34961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑