Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	692721	692734	14	33 [0]	[0] 20	hyaD	protein involved in processing of HyaA and HyaB proteins

CGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCATT  >  minE/692660‑692720                                                             | cGATGCCATTGACTTCGGGATGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1609997/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1203295/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:747793/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:715898/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:529099/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:426919/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:343826/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:3262114/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:3180770/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:3126205/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:3106936/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2943924/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2806700/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2725561/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2649800/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2561112/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2382092/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1108670/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1368991/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1384018/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1529343/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1745274/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1770300/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1821326/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:183156/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1850681/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2077269/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2243524/61‑1 (MQ=255) cGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2452049/61‑1 (MQ=255)  gATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:1703433/60‑1 (MQ=255)  gATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:2740204/60‑1 (MQ=255)  gATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:745939/60‑1 (MQ=255)                    ctggaacctggaacGCTGCGAAGCTATGCCGGAGAACGCAtt  <  1:961540/42‑1 (MQ=255)                                                             | CGATGCCATTGACTACGGGCTGGAACCTGGAACGCTGCGAACCTATGCCGGAGAACGCATT  >  minE/692660‑692720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑