Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	38782	38790	9	87 [0]	[0] 152	caiT	predicted transporter

ACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCT  >  minE/38724‑38781                                                          | aCATCAGCAACATCCCCACCGACTCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2236629/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTTAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1042510/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:370667/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2430958/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:365083/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:351628/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:345847/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:345366/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:3187219/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:317947/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2894576/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2866798/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2739257/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2739145/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2706694/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2704730/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2664721/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2590775/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2527343/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2469865/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2453117/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:956036/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:664248/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1033272/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:858512/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:804511/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:781139/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:776594/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:756486/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:727498/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:702102/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:683817/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:372215/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:656371/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:653044/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:647799/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:636192/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:534466/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:493959/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:470920/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:432405/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:396806/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1414113/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1761108/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2402958/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1744561/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:173048/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1615040/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1604425/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1547344/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1500091/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1436303/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:175739/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1392135/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1341688/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1308535/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1285055/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1255026/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1149539/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1106551/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1053357/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2001013/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2387997/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2338588/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2330622/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2236981/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2190317/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2171644/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2166673/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2059828/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2046279/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1791881/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1998596/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:193949/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1839324/58‑1 (MQ=255) aCATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1809424/58‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:3118395/57‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:636135/57‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:528110/57‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1715998/57‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1923927/57‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:886686/57‑1 (MQ=255)  cATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:945346/57‑1 (MQ=255)      aGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1769467/53‑1 (MQ=255)                ccACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:1556984/43‑1 (MQ=255)                     gAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:2211129/38‑1 (MQ=255)                      aaTCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCt  <  1:3223605/37‑1 (MQ=255)                                                          | ACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAAGTAGTTCATGATGAAGCTGGCACCGCT  >  minE/38724‑38781

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑