Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	716789	716807	19	60 [0]	[0] 22	rimJ	ribosomal‑protein‑S5‑alanine N‑acetyltransferase

AAAATGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAG  >  minE/716728‑716788                                                             | aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGATGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2513053/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:333813/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:265987/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2691714/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2704854/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2725337/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2741441/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2857368/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:3106865/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:3119371/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:3161415/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:3227417/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:3276292/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:3286254/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:331635/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:105426/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:356664/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:547994/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:598335/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:604149/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:640987/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:649204/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:771593/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:792999/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:793713/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:836918/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:877002/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:884790/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:885071/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:9636/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2636289/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1002361/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1062337/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1142187/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1216944/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1243975/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1281938/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:147593/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1535257/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1690434/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1783459/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1865830/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1933655/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:1977069/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:199541/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2095986/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2162392/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:218585/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2265854/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2312446/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2346742/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2352668/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2374474/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2464082/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2483535/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2487865/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2516770/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2587559/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAg  >  1:2658072/1‑61 (MQ=255) aaaaTGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGCTATATGCAg  >  1:968240/1‑61 (MQ=255)                                                             | AAAATGGCAGGGCAAAGGACTCATGTTTGAAGCCCTGACCGCAGCCATTCGTTATATGCAG  >  minE/716728‑716788

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑