Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	767513	767514	2	35 [0]	[0] 6	ycfD/phoQ	conserved hypothetical protein/sensory histidine kinase in two‑compoent regulatory system with PhoP

ACGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGC  >  minE/767451‑767512                                                              | aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1247733/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:894233/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:884587/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:794293/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:752891/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:752015/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:3200082/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:3154362/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:3029195/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2999684/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2972615/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2955155/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2948670/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2829786/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2784394/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2527216/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2344779/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2321746/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2042427/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1902684/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:188713/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1866422/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1794776/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1261699/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1654756/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1461702/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1548609/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:1581289/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTAAAGCATCCACAGGc  <  1:2572185/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGAATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2779201/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAATGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:111759/62‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGAAAATCGGGCCAATTAAGAGTGAGTTTGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:618524/62‑1 (MQ=255)  cGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTTGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:2687017/61‑1 (MQ=255)  cGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:379859/61‑1 (MQ=255)  cGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGc  <  1:316775/61‑1 (MQ=255)                                                              | ACGTTCAAGAAAATCGGGCCAGTTAAGAGTGAGTTGGTATTCCATGTTAAGCATCCACAGGC  >  minE/767451‑767512

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑