Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	767679	767693	15	31 [0]	[0] 11	phoQ	sensory histidine kinase in two‑compoent regulatory system with PhoP

ATCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAT  >  minE/767617‑767678                                                              | aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2543589/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:972278/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:947934/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:92581/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:647468/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:630278/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:611924/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:48877/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:350583/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:3208977/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:3026683/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2987141/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2816348/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:271327/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2659186/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2549478/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1085325/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2504080/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2393473/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2227850/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:2065450/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1945090/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1828714/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1646442/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1561813/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1500020/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1470528/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1229289/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1217398/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAt  >  1:1203611/1‑62 (MQ=255) aTCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATAATGCTCGGTGAt  >  1:1375848/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATCCGCGCACCGCCCAGCATGCTCTCTCCGGCGACGATTTTACCCTCATATTGCTCGGTGAT  >  minE/767617‑767678

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑