Missing coverage evidence...
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GATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAT  >  minE/770405‑770466                                                              | gATATACCCCCAGACGTCACGGTGAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:254564/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCTCGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2517385/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCGACGCAAt  <  1:2896392/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2035263/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:788879/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:57773/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:3193592/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:3131432/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:3078926/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2864407/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2807569/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2565684/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2420651/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2404880/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2301586/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:2203674/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1702165/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1349139/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1420540/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1433107/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1504476/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1512377/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1516449/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1534319/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1341413/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1727661/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1738650/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1754475/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1815338/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1949498/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1956874/62‑1 (MQ=255) gATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:1959214/62‑1 (MQ=255)                       tCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAt  <  1:3025912/40‑1 (MQ=255)                                                              | GATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAAT  >  minE/770405‑770466

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑