Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 773716 773741 26 65 [0] [0] 48 ymfC 23S rRNA pseudouridine synthase

CGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCTGGTG  >  minE/773654‑773715
                                                             |
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCCGCtggtg  <  1:1444476/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3100494/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2335913/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1018948/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2469116/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2544351/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2545473/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2671313/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:269317/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2830877/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2852653/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2859640/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2866155/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2881995/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2928365/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:301802/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3053293/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2454553/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3101953/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3103908/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3248108/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3251637/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:428239/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:4703/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:492909/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:53226/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:711968/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:871175/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:930229/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:973752/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:985206/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1570040/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1095406/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1131046/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1173897/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1184081/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1212067/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1240763/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1260571/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1306045/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1345500/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1349220/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1351701/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1376094/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:150550/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1550633/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2328978/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1605190/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2213400/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2191552/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2174519/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2125312/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2033486/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2012812/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1946451/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1930362/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1796806/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1728469/62‑1 (MQ=255)
cGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1613433/62‑1 (MQ=255)
 ggTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:546794/61‑1 (MQ=255)
 ggTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:92215/61‑1 (MQ=255)
 ggTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:3043376/61‑1 (MQ=255)
                cTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2760546/46‑1 (MQ=255)
                   gCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:1696492/43‑1 (MQ=255)
                        tACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCtggtg  <  1:2854928/38‑1 (MQ=255)
                                                             |
CGGTCATGCGGCGCACCTGGCGATTACGTCCTTCATATAAGGTGATCTTCAGCCAGCTGGTG  >  minE/773654‑773715

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: