Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	789974	789984	11	77 [0]	[0] 33	dadA	D‑amino acid dehydrogenase

AATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAA  >  minE/789911‑789973                                                               | aaTTCCGGGCAAATCT‑CCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2774723/62‑1 (MQ=39)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGTTATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2213140/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:982940/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:298939/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3028659/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3028691/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3107532/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2448257/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2301905/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2215006/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2145767/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2100507/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:653216/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1867707/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1629930/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1618003/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1470225/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1324311/62‑1 (MQ=255)  aTGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1428028/62‑1 (MQ=255)          cAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1936650/54‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGGACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:233668/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCTTGTGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2775824/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCATCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:820044/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:391065/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:840466/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3249690/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3217329/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3195803/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:90569/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:972182/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:979294/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:3004827/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:274972/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2964246/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:871468/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:420878/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:571751/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:599968/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:636708/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:774494/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:770649/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:665264/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:678633/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:679476/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:706744/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:755418/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2154521/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1114034/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1186519/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1286824/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1295306/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1349241/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1352994/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:135323/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1515851/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1531002/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1738770/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1774932/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1805428/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1807952/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:191800/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1999240/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2937480/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2177474/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2249143/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2413008/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2464269/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2544798/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2582469/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2680654/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:1085928/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2823355/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2841000/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGGGTGCCTTTaaaa  <  1:3215632/49‑1 (MQ=255)               ctcCCCCGGATATGCTGCACCATGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2784661/49‑1 (MQ=255)                       gATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2984621/41‑1 (MQ=255)                             ctgcACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTaaaa  <  1:2820947/35‑1 (MQ=255)                                                               | AATGCCGGGCAAATCTCCCCCGGATATGCTGCACCGTGGGCGGCACCAGGTGTGCCTTTAAAA  >  minE/789911‑789973

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑