Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	796628	796734	107	45 [0]	[0] 11	ycgR	protein involved in flagellar function

GCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAG  >  minE/796566‑796627                                                              | gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACTAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1672322/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTTATCAg  >  1:1990376/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2506844/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2473301/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2553010/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2741912/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2755334/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2895464/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2901360/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:3200642/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:367240/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:452168/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:540781/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:571187/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:679257/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:683044/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:730265/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:766501/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:776310/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:789169/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:819928/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:828803/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:919317/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2108946/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1129717/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1191315/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1353208/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1413830/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1463048/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1596668/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1650088/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:177617/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1899024/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2038438/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2504895/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2128027/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2142884/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2188051/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2228530/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2254946/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2410848/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2433125/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2436324/1‑62 (MQ=255) gCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:1103656/1‑62 (MQ=255) gCTTGACCGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAg  >  1:2876647/1‑62 (MQ=255)                                                              | GCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCGGGGTTATTGCCAGTAATTTGCTGATCAG  >  minE/796566‑796627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑