Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	49485	49485	1	24 [0]	[0] 10	ksgA	S‑adenosylmethionine‑6‑N',N'‑adenosyl (rRNA) dimethyltransferase

AGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACAC  >  minE/49423‑49484                                                              | aGGGTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:804286/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1391365/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:976731/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:657255/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:648371/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:561256/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:419674/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:3171409/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:3138227/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:2505212/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:2381337/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:2153408/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:2148687/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1979330/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1949665/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1840674/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1576374/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1527284/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:1321937/62‑1 (MQ=255) aGGCTGTTACGAATGGTTTTACCACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:3135109/62‑1 (MQ=255)  ggCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:2689152/61‑1 (MQ=255)  ggCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:3080086/61‑1 (MQ=255)  ggCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:191147/61‑1 (MQ=255)            aaTGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAacac  <  1:2593958/51‑1 (MQ=255)                                                              | AGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACAC  >  minE/49423‑49484

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑